PBA单囊泡膜蛋白质组学
产品介绍 单囊泡膜蛋白组学是基于邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay, PBA)对单个细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs )的特定膜蛋白进行靶向检测。
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产品介绍
单囊泡膜蛋白组学是基于邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay, PBA)对单个细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs )的特定膜蛋白进行靶向检测。 PBA 技术首先对相应蛋白的抗体和细胞外囊泡分别进行特异性 DNA 编码,将二者连接,即可通过测序高通量地获得数百万个 EVs 表面膜蛋白的种类和数量信息,获取单EV膜蛋白表达图谱; 1、单囊泡膜蛋白组学可基于单EV膜蛋白表达图谱对EVs进行分群,绘制EVs的亚群组成图谱,研究EVs的异质性; 2、通过对EVs亚群分析、膜蛋白表达和膜蛋白组合等方面分析,发现一些稀有亚群和低丰度蛋白,筛选疾病早筛、预后、耐药、转移等生物标志物; 3、有可能对EVs核心亚群进行溯源预测和荷载功能分子分析,解析EVs通过介导细胞通讯调节靶细胞,影响疾病发生发展的分子机制
• 单EV图谱绘制 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 • 机制研究 分析不同生理病理过程EV亚群丰度多样性变化,挖掘EV核心亚群;对核心亚群进行溯源分析和荷载功能分子预测,解析核心亚群影响疾病发生发展的分子机制 分析不同生理病理过程EV亚群丰度多样性变化,挖掘EV核心亚群;对核心亚群进行溯源分析和荷载功能分子预测,解析核心亚群影响疾病发生发展的分子机制 • 标志物研究 单EV水平检测,研究疾病相关核心EV亚群,尤其是稀有亚群/低丰度蛋白,基于亚群/差异蛋白/膜蛋白组合作为biomarker,提高检测准确性和检测下限 单EV水平检测,研究疾病相关核心EV亚群,尤其是稀有亚群/低丰度蛋白,基于亚群/差异蛋白/膜蛋白组合作为biomarker,提高检测准确性和检测下限
• 角度新颖 单EV水平检测 解析EVs异质性 涵盖细胞特异性膜蛋白 有可能实现EVs溯源 单EV水平检测 解析EVs异质性 涵盖细胞特异性膜蛋白 有可能实现EVs溯源 • 高通量检测 单次检测可获得 约几十万-100w个单EV水平 550+人/200+小鼠膜蛋白表达图谱 单次检测可获得 约几十万-100w个单EV水平 550+人/200+小鼠膜蛋白表达图谱 • 微量检测 单次检测仅需50µl外泌体 兼容细胞上清、各类体液和组织样本 单次检测仅需50µl外泌体 兼容细胞上清、各类体液和组织样本 • 高灵敏检测 单EV分辨率检测 外泌体亚群检出下限低至0.1% 单EV分辨率检测 外泌体亚群检出下限低至0.1% • 专注膜蛋白 无需提取外泌体蛋白 操作简单 验证手段多样 易于转化 无需提取外泌体蛋白 操作简单 验证手段多样 易于转化
产品介绍
单囊泡膜蛋白组学是基于邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay, PBA)对单个细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs )的特定膜蛋白进行靶向检测。 PBA 技术首先对相应蛋白的抗体和细胞外囊泡分别进行特异性 DNA 编码,将二者连接,即可通过测序高通量地获得数百万个 EVs 表面膜蛋白的种类和数量信息,获取单EV膜蛋白表达图谱; 1、单囊泡膜蛋白组学可基于单EV膜蛋白表达图谱对EVs进行分群,绘制EVs的亚群组成图谱,研究EVs的异质性; 2、通过对EVs亚群分析、膜蛋白表达和膜蛋白组合等方面分析,发现一些稀有亚群和低丰度蛋白,筛选疾病早筛、预后、耐药、转移等生物标志物; 3、有可能对EVs核心亚群进行溯源预测和荷载功能分子分析,解析EVs通过介导细胞通讯调节靶细胞,影响疾病发生发展的分子机制。 • 单EV图谱绘制 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 • 机制研究 分析不同生理病理过程EV亚群丰度多样性变化,挖掘EV核心亚群;对核心亚群进行溯源分析和荷载功能分子预测,解析核心亚群影响疾病发生发展的分子机制 分析不同生理病理过程EV亚群丰度多样性变化,挖掘EV核心亚群;对核心亚群进行溯源分析和荷载功能分子预测,解析核心亚群影响疾病发生发展的分子机制 • 标志物研究 单EV水平检测,研究疾病相关核心EV亚群,尤其是稀有亚群/低丰度蛋白,基于亚群/差异蛋白/膜蛋白组合作为biomarker,提高检测准确性和检测下限 单EV水平检测,研究疾病相关核心EV亚群,尤其是稀有亚群/低丰度蛋白,基于亚群/差异蛋白/膜蛋白组合作为biomarker,提高检测准确性和检测下限 • 角度新颖 单EV水平检测 解析EVs异质性 涵盖细胞特异性膜蛋白 有可能实现EVs溯源 单EV水平检测 解析EVs异质性 涵盖细胞特异性膜蛋白 有可能实现EVs溯源 • 高通量检测 单次检测可获得 约几十万-100w个单EV水平 550+人/200+小鼠膜蛋白表达图谱 单次检测可获得 约几十万-100w个单EV水平 550+人/200+小鼠膜蛋白表达图谱 • 微量检测 单次检测仅需50µl外泌体 兼容细胞上清、各类体液和组织样本 单次检测仅需50µl外泌体 兼容细胞上清、各类体液和组织样本 • 高灵敏检测 单EV分辨率检测 外泌体亚群检出下限低至0.1% 单EV分辨率检测 外泌体亚群检出下限低至0.1% • 专注膜蛋白 无需提取外泌体蛋白 操作简单 验证手段多样 易于转化 无需提取外泌体蛋白 操作简单 验证手段多样 易于转化
结果展示
统计每个样本中所检测到的每种蛋⽩的总表达量,数据为Protein Expression rawdata。采⽤trimmed mean of M values(TMM)⽅法对数据进⾏标准化,以消除检测数据量的差异带来的影响。然后基于标准化的数据进行蛋白表达整体分析,差异分析和差异蛋白的ROC分析。
常见问题
Q: 单囊泡膜蛋白组学项目周期是 单囊泡膜蛋白组学项目周期是 A: 单囊泡膜蛋白组学项目周期因样本数而异:单批次样本数 80,协调周期。 Q: 单囊泡膜蛋白组学项目交付内容有 单囊泡膜蛋白组学项目交付内容有 A: 恩泽较交付客户的内容包括:分析结果文件和结题报告。不包括测序的原始数据,发表文章时无须提交原始数据,因为测序针对的是自主合成设计的序列。 Q: 普通蛋白组和膜蛋白有必要一起做吗? 普通蛋白组和膜蛋白有必要一起做吗? A: 依据具体需求而定,非靶向的蛋白组学包含膜蛋白信息,但是会缺失低丰度的膜蛋白且膜蛋白检出有限。如果非常关注某些膜蛋白,PBA检测列表中也有,可以普通组学和单外泌体联合分析。二者联合主要达到相互补充提高蛋白检出的完整性,根据EV亚群marker蛋白的表达水平和bulk蛋白的表达水平,预测EV亚群负载的功能蛋白。或者将PBA检测结果和质谱检测结果进行联合构建诊断模型。 Q: 如何确保检测的是单囊泡? 如何确保检测的是单囊泡? A: a.通过控制外泌体等囊泡的上样浓度来控制多外泌体的概率 b.通过控制捕获囊泡的芯片点阵密度(通过扫描电镜观察PBA芯片上捕获的囊泡时,很少看到多囊泡,如DOI: 10.34133/research.0041) 当然,如果上机时囊泡已经发生聚团,无法避免会测到该聚团,也就不是单囊泡水平检测了,因此需要注意分离的囊泡的聚团情况。 Q: PBA如何发现和验证标志物: PBA如何发现和验证标志物: A: a.标志物发现阶段,建议采用大样本直接采用PBA-260进行检测,数据分发现队列和验证队列进行标志物性能验证,具体可以参考PBA助力结直肠癌EV早筛标志物研究的思路(DOI: 10.34133/research.0041) b.后期大样本/多中心验证标志物,可以采用少量样本直接血浆检测膜蛋白标志物,判断是否可以免分离直接检测标志物,如果效果好,即采用免分离外泌体的方法进行验证; 其他验证技术可以选择:纳米流式、免疫-PCR、免疫磁珠分选检测等低通量靶向检测技术。具体可以参考免疫PCR助力肝癌EV早筛标志物研究的思路(doi: 10.1002/hep.32692) Q: 单囊泡膜蛋白组学研究的意义 单囊泡膜蛋白组学研究的意义 A: a.解析外泌体异质性。分析外泌体亚群及亚群丰度与疾病的关系,找寻核心亚群,发现标志物或关键分子。 b.检出灵敏度高,有利于检出低丰度蛋白,和发现低丰度亚群,有利于早筛标志物的发现。 c.膜蛋白临床价值大。膜蛋白占基因1/4,是信号传导关键,可以解析微环境中的细胞通讯;占药物靶点60%以上。 c.外泌体亚群进行溯源。膜蛋白富含CD marker,具有溯源的潜能性,解析核心外泌体亚群来源细胞/组织,链接临床标志物和机制研究。 d.微量检测易于转化。样本需求量少,膜蛋白具有免分离直接检测的潜能性,检测方式多样,易于临床直接转化。
送样建议
根据项目经验和文章调研情况进行推荐;样本是否合格(满足下游研究需求)以质控检测结果为准。 详细样本制备和前处理建议,请与我司本地销售联系,获取恩泽康泰 《外泌体组学研究送样指导》 进行参考。
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常见问题
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 是什么服务?
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 是「外泌体前沿新技术」栏目下的外泌体技术服务。产品介绍 单囊泡膜蛋白组学是基于邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay, PBA)对单个细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs )的特定膜蛋白进行靶向检测。
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 适合哪些研究需求?
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 可支持的研究需求包括:产品介绍;单囊泡膜蛋白组学是基于邻近编码技术(Proximity Barcoding Assay, PBA)对单个细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EVs )的特定膜蛋白进行靶向检测。;• 单EV图谱绘制 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 绘制单EV精度蛋白表达图谱,解析EV亚群组成和多样性,研究外泌体异质性 • 机制研究 分析不同生理病理过程EV亚群丰度多样性变化,挖掘EV核心亚群…。
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 的服务流程或内容包括哪些?
- 当前页面围绕 产品介绍、结果展示、常见问题、送样建议、关联产品 等模块展开说明。
- PBA单囊泡膜蛋白质组学 可以交付哪些结果?
- 交付内容通常围绕检测结果、分析数据、图表或项目报告展开,具体交付格式和深度需根据服务方案、样本情况和项目目标确认。
- 如何咨询 PBA单囊泡膜蛋白质组学?
- 可通过官网联系恩泽康泰,提供样本类型、研究目的、预期检测项目和时间要求后,进一步确认PBA单囊泡膜蛋白质组学的服务方案。