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外泌体组学研究

Multi-omics Studies of Extracellular Vesicles

首页 > 外泌体组学 > 体液外泌体长链RNA组学

外泌体长链RNA项目最终交付给客户的内容有?

恩泽交付客户的内容包括:测序原始数据、分析结果文件和结题报告。

外泌体长RNA测序分析项目周期是?

外泌体长RNA测序分析项目周期因样本数而异:样本数量<50个周期是35个工作日;样本数量50-100周期是45个工作日。

外泌体长链RNA测序数据量是多少?

外泌体长链RNA建议测序数据量是20G。1.是因为外泌体长链RNA的mapping率偏低,一般在60-80%之间有效数据会偏低;2.是因为外泌体长链RNA 核糖体占比偏高,影响有效数据的含量;3.外泌体富含低丰度的转录本,为了确保RNA检出的完整性,需要较高的数据量。

外泌体测序样本间相关性怎么样?

外泌体测序样本间的相关性相对比较差。主要是因为外泌体的来源比较丰富,所有细胞都有可能分泌外泌体,因此背景信号比较杂,个体差异较大,建议组内多做平行降低个体差异对分析结果的影响;而实验偏差引入的误差可控:我们同一个样本两次重复测序的相关性大于90%(从血浆外泌体提取步骤开始)。

外泌体lncRNA测序数据链特异性系数偏低的原因是?

外泌体含有一定量的DNA,提取的外泌体RNA 中会存在DNA的污染,影响文库的链特异性系数。恩泽会在RNA质控过程中评估gDNA的含量降低测序数据链特异性系数偏低的风险。
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