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外泌体组学研究

Multi-omics Studies of Extracellular Vesicles

首页 > 外泌体组学 > PBA单囊泡膜蛋白质组学
囊泡总蛋白表达分析
统计每个样本中所检测到的每种蛋⽩的总表达量,数据为Protein Expression rawdata。采⽤trimmed mean of M values(TMM)⽅法对数据进⾏标准化,以消除检测数据量的差异带来的影响。然后基于标准化的数据进行蛋白表达整体分析,差异分析和差异蛋白的ROC分析。
囊泡表面蛋白组合分析
基于PBA技术实现对单囊泡蛋⽩组合的检测,可探究在单个EV⽔平上,多种蛋⽩共表达、共定位的关系以及共同参与复杂⽣物学功能的可能性。该部分,统计了单EV蛋⽩组合丰度,即每个样本中各种可能的蛋⽩组合出现的次数,基于每种EV蛋⽩组合出现的次数,进⾏CPM的校正,而后进行整体分析和差异分析以及ROC分析。
单囊泡亚群聚类分析
该部分是单囊泡膜蛋白组学特有分析,基于海量的单囊泡膜蛋白表达数据进⾏外泌体亚群分析和亚群标志物的鉴定。
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